BIMS direktor və Elmi Məsləhət Şurası tərəfindən  idarə olunur. Onların vəzifələri  aşağıda təsvir edilmişdir.

Direktor

Direktora institutun ümumi funksiyalarını idarə etmək və institutun gündəlik fəaliyyətlərinin səmərəli və effektiv şəkildə həyata keçirilməsini təmin etmək həvalə edilir. Direktorun əsas vəzifələri aşağıdakılardır:

Strateji Liderlik: Direktor institut üçün tədqiqatlar planı müəyyən edir, riyaziyyat sahəsində son nailiyyətləri və qlobal riyazi icmada yaranan yenilikləri nəzərə alaraq uzunmüddətli tədqiqat prioritetlərini təyin edir.

Resursların İdarə Edilməsi: Büdcə nəzarəti, maliyyə vəsaitlərinin cəlb edilməsi və tədqiqatçılara maliyyə, texniki və insan resursları baxımından lazımi şəraitin təmin edilməsini həyata keçirir.

Tədqiqat Mühiti: Əməkdaşlığa əsaslanan intellektual mühiti təşviq edir. Direktor gənc və təcrübəli tədqiqatçılar arasında qarşılıqlı əlaqənin təmin olunması üçün multidissiplinar əməkdaşlığı, seminarları fəal şəkildə həyata keçirməlidir.

 İşə Qəbul və Mentorluq: Post Doktorantların fakültədə işə qəbulunda və ziyarətində liderlik təmin edir. Gənc tədqiqatçıların akademik və peşəkar inkişafında yüksək səviyyədə mentor kimi iştirak edir.

 Xarici Əlaqələr: Direktor institutu akademik, sənaye və ictimai forumlarda təmsil edir; tərəfdaşlıqlar yaradır və mərkəzin əməkdaşlıq şəbəkəsini genişləndirir. Həmçinin, mərkəz haqqında  ictimaiyyətə geniş  məlumat verilməsi və ictimai fəaliyyətlərin həyata keçirilməsindən məsuldur.

Elmi Məsləhət Şurası

Elmi Məsləhət Şurası, institutun tədqiqat istiqamətinin riyaziyyat sahəsində qabaqcıl mövqedə qalmasını təmin etmək üçün yüksək səviyyəli rəhbərlik və strateji nəzarət təqdim edir. Şura üzvləri,  bu sahədə tanınmış mütəxəssislər olaraq, institutun uzunmüddətli planını  müəyyənləşdirir və əsas məsələlərdə öz bilik və təcrübələrini bölüşürlər. Şuranın əsas vəzifələri aşağıdakılardır:

Strateji Rəhbərlik: Direktorla institutun tədqiqat prioritetlərini müzakirə edir, uzunmüddətli məqsədləri müəyyənləşdirir və institutun riyaziyyat sahəsində ortaya çıxan vacib istiqamətlərə diqqəti cəlb etməsini təmin edir.

Tədqiqatın Qiymətləndirilməsi: İnstitutun tədqiqat keyfiyyəti və təsirini nəzərdən keçirir, institutun fəaliyyətlərinin qlobal riyaziyyat icmasına əhəmiyyətli töhfə verməsini təmin etmək üçün rəy bildirir.

Şəbəkə və Əməkdaşlıq: Qlobal şəbəkələrindən istifadə edərək digər tədqiqat institutları, universitetlər və sənaye tərəfdaşları ilə əməkdaşlığı təşviq edir, institutun beynəlxalq əlaqələr qurmasına və tanınmasında kömək edir.

Direktora Mentorluq: Direktora strateji qərarlar və problemlər üzrə təlimatlar verir, yeni təşəbbüslər və uzunmüddətli planlaşdırma üçün məsləhətçi kimi çıxış edir.

İnnovasiyanın Təşviqi: İnnovasiyaları və multidissiplinar əməkdaşlıqları təşviq edir, institutun  ənənəvi riyaziyyatdan kənar sahələrlə məşğul olaraq  yeni tədqiqat istiqamətlərini təşviq edə biləcəyi  yollar haqqında  məsləhət verir.

Hesabatlılıq və İrəliləyiş: İnstitutun tərəqqisini  və təsirini müntəzəm olaraq nəzərdən keçirməklə məşğul olur, layihələrin öz aktuallığını qorumasına görə cavabdeh olur  və yerinə yetirilən riyazi tədqiqatın qabaqcıl mövqeyini qorumaq üçün lazım gəldikdə strategiyanı dəyişdirir.